明

洪武初年 设南海卫于县治南。

十六年(1383年) 冈疍户起义，后为都指挥同知花茂所镇压。

十九年(1386年) 曹真起义，后为南雄侯赵庸所镇压。

二十七年(1394年) 置东莞(南头)守御千户所和大鹏守御千户所，隶属南海卫。

正统十三年(1448年) 南海黄萧养起义，聚众十余万人，称东阳王，势及东莞。明都指挥使王清从高州率兵来援，四月十八日，到东莞沙角尾地方，为起义军所擒杀。总兵安乡伯张安亦率水师来攻，在东莞船澳与义军相遇，为义军击败，追至沙角尾，官军溃散，张安溺死。

景泰元年(1450年) 彭亚六起义，后被南海卫指挥韦俊所击杀。

天顺五年(1461年) 东莞大饥荒，黄涵聚众二百余人起义，后被知县吴中所镇压。

正德元年(1506年) 葡萄牙人东来以进贡讨封为名，占领东莞县境濒海的屯门、海澳。

八年(1513年)四月 东莞霪雨，山洪暴涨，南城门外平地水深五六尺，城门及民房尽被毁坏。

十六年(1520) 巡道汪鋐驱逐侵占屯门、海澳之葡萄牙人船只。此为广东与欧洲人战争之始。

嘉靖六年(1527年) 东莞人麦允奇起义，后被东莞县主簿唐尧佐镇压于伶仃洋。

四十年(1561年) 东莞大饥，群众纷纷揭竿而起。八月，东莞义军攻入增城城中，与增城义军汇合，后被海道副使郑维城所镇压。

万历元年(1573年) 分东莞县地五十六里，即分东莞守御千户所，另立新圣县。

十年(1582年) 疍民梁本豪起义，后被总督陈瑞及总兵官黄应甲合谋生擒。

十四年(1586年) 东莞大饥，斗米卖二百钱。

四十六年(1618年) 十二月，连续天阴，寒甚，白天雪下如珠，后又下如鹅毛，持续六至八日乃止。后连年丰收。

泰昌元年(162胥0年) 东莞大饥。

崇祯元年(1628年) 抗清名将东莞人袁崇焕受诬下狱，于崇祯三年惨遭磔刑。

九年(1636年) 东莞大饥。

十年(1637年) 英国兵船初进虎门。